Na przebieg nadzoru przyrodniczego ma wpływ wiele czynników, m.in.:
- zakresu prac,
- zapisy w decyzji środowiskowej,
- warunki atmosferyczne wpływające na biologię roślin i zwierząt.
W niektórych przypadkach obecność nadzoru będzie miał charakter stały, w innych będzie okresowy. Przyjęło się, że pod koniec miesiąca sporządzany jest raport z wynikami prac i zaleceniami na kolejny okres sprawozdawczy.